Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPN6Q9Y6Q1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAPN6Q9Y6Q1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAPN6Q9Y6Q1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAPN6Q9Y6Q1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAPN6Q9Y6Q1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAPN6Q9Y6Q1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
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