Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR1DQ9Y2S0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR1DQ9Y2S0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms