Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SETD1BQ9UPS6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SETD1BQ9UPS6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms