Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF3Q9ULD4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms