Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP45Q9UL16 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFAP45Q9UL16 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms