Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLIP2Q9UDT6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLIP2Q9UDT6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms