Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PEF1Q9UBV8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEF1Q9UBV8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms