Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLKQ9UBT6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
POLKQ9UBT6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms