Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KLHL9Q9P2J3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL9Q9P2J3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms