Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms