Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCHIP1Q9P0W5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms