Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CDK12Q9NYV4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms