Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms