Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DNAJC28Q9NX36 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms