Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms