Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP8A2Q9NTI2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms