Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOPORSQ9NS56 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOPORSQ9NS56 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms