Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LHX9Q9NQ69 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LHX9Q9NQ69 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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