Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD3Q9H7E2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms