Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF1DQ9H5J8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms