Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDGFDQ9GZP0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFDQ9GZP0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms