Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNTNAP4Q9C0A0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP4Q9C0A0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms