Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CRNKL1Q9BZJ0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRNKL1Q9BZJ0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms