Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SETD2Q9BYW2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SETD2Q9BYW2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SETD2Q9BYW2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms