Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VAMP8Q9BV40 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
VAMP8Q9BV40 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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