Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAGR1Q9BTK6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAGR1Q9BTK6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAGR1Q9BTK6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAGR1Q9BTK6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAGR1Q9BTK6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAGR1Q9BTK6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAGR1Q9BTK6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAGR1Q9BTK6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAGR1Q9BTK6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PAGR1Q9BTK6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAGR1Q9BTK6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAGR1Q9BTK6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAGR1Q9BTK6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAGR1Q9BTK6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms