Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLF1Q9BQI6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLF1Q9BQI6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms