Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGIP1Q9BQI5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms