Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TREX2Q9BQ50 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms