Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPS6KC1Q96S38 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPS6KC1Q96S38 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms