Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC4A9Q96Q91 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A9Q96Q91 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms