Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms