Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A4AQ96JQ5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms