Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EAF1Q96JC9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms