Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ABCC11Q96J66 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms