Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMARCE1Q969G3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms