Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-CQ95604 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HLA-CQ95604 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms