Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF25Q93038 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms