Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf3Q8WVX3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf3Q8WVX3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms