Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY8

IGDCC4, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC4Q8TDY8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGDCC4Q8TDY8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms