Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD1Q8NHV4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms