Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC155Q8N6L0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms