Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT4

TRIM50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM50Q86XT4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM50Q86XT4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM50Q86XT4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM50Q86XT4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM50Q86XT4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM50Q86XT4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM50Q86XT4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms