Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF550Q7Z398 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms