Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRCQ7RTU9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
STRCQ7RTU9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms