Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q71RC1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q71RC1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q71RC1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q71RC1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q71RC1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q71RC1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q71RC1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q71RC1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q71RC1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q71RC1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q71RC1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q71RC1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q71RC1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q71RC1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q71RC1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q71RC1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q71RC1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q71RC1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q71RC1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q71RC1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q71RC1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q71RC1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q71RC1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q71RC1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q71RC1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q71RC1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q71RC1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q71RC1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q71RC1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q71RC1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q71RC1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q71RC1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q71RC1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q71RC1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q71RC1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q71RC1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q71RC1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q71RC1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q71RC1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q71RC1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q71RC1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q71RC1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q71RC1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q71RC1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q71RC1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q71RC1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q71RC1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q71RC1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q71RC1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q71RC1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q71RC1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q71RC1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q71RC1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q71RC1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q71RC1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q71RC1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q71RC1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q71RC1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q71RC1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q71RC1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q71RC1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q71RC1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q71RC1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q71RC1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q71RC1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q71RC1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q71RC1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q71RC1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q71RC1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q71RC1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q71RC1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q71RC1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q71RC1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q71RC1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q71RC1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q71RC1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q71RC1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q71RC1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q71RC1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q71RC1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q71RC1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q71RC1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q71RC1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q71RC1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q71RC1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q71RC1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q71RC1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q71RC1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q71RC1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q71RC1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q71RC1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q71RC1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q71RC1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q71RC1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q71RC1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q71RC1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q71RC1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q71RC1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q71RC1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms