Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
USP31Q70CQ4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP31Q70CQ4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
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