Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM43Q6ZSC3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms