Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABRAXAS1Q6UWZ7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms