Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRSAM1Q6UWE0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms